Am 3. April 1312 verkündete der Papst die Auflösung des Ordens:

„In Anbetracht des schlechten Rufes der Templer, des Verdachtes und der Anklagen, die gegen sie bestehen, in Anbetracht der geheimnisvollen Aufnahme in diesen Orden, der schlechten und unchristlichen Lebensführung vieler Mitglieder, in Anbetracht des Eides, nichts über die Aufnahme zu offenbaren oder aus dem Orden auszutreten, in Anbetracht des Skandals, der nicht mehr gutzumachen ist, in Anbetracht der Häresie, der Glaube und Seelen ausgesetzt sind, der schrecklichen Untaten einer großen Anzahl der Mitglieder des Ordens, in Anbetracht, daß die römische Kirche andere berühmte Orden wegen geringerer Motive auflöste, lösen wir nicht ohne Ritterlichkeit und inneren Schmerz, nicht Kraft einer richterlichen Sentenz, sondern durch apostolische Verfügung den sogenannten Orden der Templer mit allen Institutionen auf.“

Damit war der Orden endgültig ausgelöscht und der Besitz an die Johanniter übergeben.

Am 18. März 1814 erklärte Philipp der Schöne die Angeklagten, Molay und Pairaud, für schuldig und ließ sie als Zeichen seines Sieges auf dem Scheiterhaufen verbrennen.                 Jacques de Molay verfluchte vor seinem Tod den König und den Papst. Sie starben im selben Jahr , indem Molay und Piraud verbrannt wurden.
Später wurden die noch übrig gebliebenen Schuldbekennenden freigelassen. Manche flohen auf die britischen Inseln, andere schlossen sich anderen Orden an.               
In Portugal wurde der Namen des Ordens geändert („Ritter von Jesus Christus“), dieser existierte dann bis 1830.            
Des Weiteren wird vermutet, dass der Orden insgeheim noch heute besteht und nie wirklich aufgelöst wurde.